Hace 10 años, un joven chico fue capturado en un incendio masivo que mató a sus padres y destruyó la ciudad; mientras moría, un hombre lo salvó.

Rin parece tener problemas con el sirviente que tiene y el hecho que no tenía el poder suficiente para llamar a un sirviente más poderoso.

Shirou sigue perdido e inmensamente confundido después de ver a una elegante guerrera...

Tras la reunión con Kirei Kotomine, Shirou y Rin salen de la iglesia sólo para encontrarse Master que lleva el nombre de, Illyasviel von Einzbern.

Shirou le presenta Saber a Sakura y a la profesora diciendo que ella es un familiar lejano.

Durante su pelea con Rin, Shiro es distraído por un grito desde abajo, y descubre a una niña inconsciente.

Saber confronta a Shirou por no haberla convocado en contra de Rider.

Luego de rechazar la oferta de Shinji para formar una alianza, Shirou informa a Rin y Saber sobre una bruja en el santuario local.

Saber está ansioso de ir al templo, pero Shirou insiste en no ir, porque parece demasiado peligroso.

Shirou tiene su primera sesión de entrenamiento con Saber, pero tiene un pobre desempeño durante la batalla.

Después de sesiones de entrenamiento en las mañanas  con Saber, Shirou es luego arrastrada directamente por Rin para más entrenamiento.

Shirou está preocupado por el bienestar de sus estudiantes, después de los eventos de ayer, él está  preocupada por Taiga, quien se está recuperando.

Shirou se queda dormida y tiene un sueño, es un flashback del pasado de Saber.

Rin, Saber y Archer están afuera de la mansion de Ilya. Ven a Ilya irse, por lo que entran para rescatar a Shirou.

Archer ha sido derrotado por su el invencible Beserker y ahora Shirou, Saber y Rin están tratando de escapar del mismo destino.

La batalla está en el punto de quiebre, cuando Rin está apunto de ser descuartizado por Beserker y Saber es incapaz de salvarla.

Shirou se despierta luego de tener otro sueño sobre el pasado de Saber y claramente está alterada por lo que pasó.

Shirou, Saber y Rin están a tan sólo pasos del templo. Assassin aparece, deja pasar a Shirou y a Rin, pero pelea con Saber.

Las peleas de Saber con Assassin y de Shirou con Souichirou alcanza el climax.

Shirou lleva a Saber en una cita para tartar de convencerla que no utilice el Grial y volver a  su propio tiempo, pero quedarse en éste tiempo.

Shirou se encuentra atrapado en el mismo lugar donde Kirei Kotomine atrapó a su padre.